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菲波那契数列
索尼埃馆长在卢浮宫被谋杀，他在咽下最后一口气前将自己的身体摆成达·芬奇名画《维特鲁威人》的形状，以血迹在腹部画下护身符，并用荧光笔在地上写下一串数字和字体。罗伯特·兰登与索菲·奈芙经过努力，破译出事件的第一个密码——原来索尼埃写下的那串数字就是数学上著名的菲波那契数列，根据这个数列把其他字母重新排列后，就出现了莱昂纳多·达·芬奇的名字。达·芬奇的在卢浮宫展出的画作《蒙娜丽莎的微笑》成为随后的线索。
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索菲和兰登先来到最著名的《蒙娜丽莎》前期望寻求答案，却发现了作品的保护玻璃上有一行字体，在祖父留下的提示中，索菲找到达·芬奇的另一幅作品《岩间圣母》，并在油画后面发现了一把十字形的钥匙。
这个线索的破解使事件引向了秘密社团郇山隐修会，丹·布朗说，它的成员曾包括牛顿、波提切利、维克多·雨果和达·芬奇等多位历史名人。
玫瑰花梨木盒
根据十字形钥匙上留下的地址，索菲和兰登找到了一个银行的匿名保险箱，但是如何打开保险箱成为了问题。这时，兰登想起了那串菲波那契数列，密码破解，两人取出一个手工精细的花梨木盒。盒子内有圆柱状藏密筒，筒身有字母转盘，拨对通关密码，其中一端就会滑开，如果密码不正确，或者强硬打开，圆筒就会自动销毁。到了这一步，索菲和兰登也没有办法再继续破译密码，于是只好向他人求助。
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提彬爵士是宗教史学家，研究秘密社团与“圣杯”的专家，充满了神秘色彩。兰登本来希望这位老朋友能够为他提供帮助，谁知道却是自投罗网。三人先是共同解开了圆筒之谜，但密码一个接一个出现，提彬爵士竟意外遭绑架，当兰登为老友担心时，却发现一副学究气的提彬才是幕后黑手。该角色被称为电影的第二大悬疑，由“甘道夫”伊恩·麦凯伦扮演。
《最后的晚餐》
提彬爵士为这幅传世名画提供了一种独特的注解。这副壁画高4.57米，宽8.84米，取材自《圣经》的一节。画中耶稣位于正中央，双手摊开，两臂与周围的空间形成了一大一小两个倒三角形。一直以来，人们都把注意力放在了犹大身上，但提彬认为道三角形以及耶稣右手边那位年轻门徒，正是解开密码的重要线索。
编辑：尔东
