1998年，是袁惟仁音乐生涯中浓墨重彩的一年。他为那英创作了《征服》《梦醒了》《梦一场》等歌曲，其中《征服》更是成为华语乐坛的经典之作。这首歌入围第10届金曲奖最佳作词和最佳作曲人奖，红极一时，至今仍是许多人记忆中的经典旋律。写《征服》时，袁惟仁正与当时的女友吵架，处于极其沮丧无助的心境中，他将自己内心的情感融入歌曲中，用音符诠释了爱情中的无奈与挣扎，“我像是一个战败的俘虏，有再多的武器都没有办法胜利——输赢的代价是彼此粉身碎骨”，这样的歌词道尽了爱情中的苦涩与心酸。除了那英，袁惟仁还为许多歌手创作了刻画感情世界深刻动人的作品。他为郑秀文创作的《背叛》和《缺席》，为陶晶莹创作的《离开我》等，都以其细腻的情感表达和动人的旋律，深受歌迷喜爱。他的作品不仅在商业上取得了巨大成功，更在艺术上达到了很高的水准，成为华语乐坛的宝贵财富。
重回台前，坚守音乐初心2000年，袁惟仁选择重回台前，带着个人同名专辑回归乐坛。此后，他陆续发行了《你不知道的我》《木吉他》等专辑及部分单曲。他写给自己的作品带着浓重的个人印记，漂泊与感伤是歌曲里经常出现的主题。他曾在采访中说，自己就是个走唱的歌手，“从在一个城市走唱开始，一直到不同的城市走唱”，从台湾到香港，再到中国大陆，他为他走过的城市写了一些歌，用音乐记录自己的足迹和心情。在他以个人名义发行的八张专辑里，其中四张的封面都有着一把木吉他，这把木吉他不仅是他音乐的象征，更是他坚守音乐初心的见证。然而，他也曾一度远离过吉他。2005年，袁惟仁和莫凡合作开了一家音乐公司，两年后公司亏光，他遂决定回归本行。
2007年起，袁惟仁先后担任了《超级星光大道》《快乐男声》《超级女声》等节目的评委，在这段时间里，他觉得自己离音乐更远了，甚至一度不太会弹吉他了，但他始终没有忘记自己对音乐的热爱。
病魔侵袭，音乐传奇落幕然而，命运却对这位音乐才子开了一个残酷的玩笑。2018年10月17日，袁惟仁在上海意外跌倒，头部受伤引发脑溢血，被送医治疗，检查时发现脑内还有肿瘤。虽然开刀后情况有所好转，但他一直昏迷不醒。12月18日，袁惟仁苏醒，但此后他的身体状况每况愈下。2020年7月，他在家中再度跌倒撞到头，住进加护病房治疗，此后便长期卧床。2022年1月，据台媒报道，袁惟仁被医生判定为无意识状态，即植物人。在袁惟仁病倒后，演艺界的朋友们纷纷伸出援手，在经济上给予帮助，演艺基金会也跟家人保持联系并固定探访。尽管他陷入了无意识的状态，但他的音乐依然在世间流传，陪伴着无数歌迷。2025年11月29日，袁惟仁疑因身体不适，由救护车紧急送往医院诊治，虽然最终还是没能战胜病魔，但他在乐坛留下的足迹将永远被铭记。
袁惟仁的去世，是华语乐坛的一大损失。他用自己的才华和努力，为华语乐坛的黄金时代增添了绚丽的色彩。他的歌曲，如同一颗颗璀璨的星星，照亮了无数人的青春岁月。如今，他虽已离去，但他留下的音乐将永远陪伴着我们，成为我们心中永恒的回忆。就像家属所说的那样，庆幸他留下了众多歌曲，想念时听，开车时听，伤心时听，平静时听……他无处不在。愿袁惟仁在天堂安息，继续弹奏着他心爱的吉他，唱着他深情的歌。
